跳槽之后申请国自然基金的身份问题

当然算B单位的人，而且需要填写为什么在不同单位申请自然基金那一项。
 
人事关系、档案在哪儿你就在哪儿。但要在正文中相应部分（后半部分）解释你作为参与人以不同单位申报基金的情况。再补充一下，你如果不是高级职称不用在正文里解释。