今年的国基经费预算里是否可以列支专利申请等费用？

可以呀，按照预期研究成果中列入的专利项数计算！

教科技〔2020〕1 号
5. 明确产权归属与费用分担。允许高校开展职务发明所有权改革探索，并按照权利义务对等的原则，充分发挥产权奖励、费用分担等方式的作用，促进专利质量提升。
发明人不得利用财政资金支付专利费用。

按照 教育部 国家知识产权局 科技部关于提升高等学校专利质量促进转化运用的若干意见 中的规定，专利费用应该是不准报销了。

基金委没有明确的文件说专利申请经费不能列支，但据目前这形式不列也罢。