我的青年基金和本科论文会查重吗？

申请在前，毕业论文在后，一般不会影响，结题是三年后的事，研究成果哪是本科论文能比的。

除非本科论文作者举报你抄袭，不然谁会去查本科论文。
 
另外提醒两点：1、如果有人举报的话这个事情还是能解释清楚的；2、自己的研究成果不要随便拿出去送人，这是学术道德。

没事，你可以举证，是你先申请的，不管中没中，你提交申请材料的时间是可以查到的，你先，他后。